要通过认证，申请者首先需要进行BAP认证申请。一旦通过申请，申请单位必须接受至少3个月的实地检验并依据可追溯性需求做现行的生产记录。检验合格后，申请单位需根据全年水产品生产总量来支付认证费用。 加工工厂，养殖场，孵化场 实地检验期间，检验人员会审查记录、检查程序，并考虑人力资源。在接受审查单位，检验人员会进行污水抽样检验，以确定是否符合BAP标准。对于加工工厂和再包装工厂，检验人员会从三个车间抽取样本或加工成品，送抵BAP认证实验室进行检验。在虾养殖场，检验员会随机抽取样本，验证其健康状况，并申明问题病虾。所有检验费用由申请单位支付。 认证费用以申请单位上一个日历年的外贸出口量为基础。年出口量为1,000公吨及以下的单位最低支付费用为2,000美元。出口量更大的单位则需在原有基础上 通过认证单位可在广告宣传及水产品零售包装上显示与认证协议及参考出版物中一致的BAP认证标志。 这些信息须上载到可追溯注册网站，以便清晰获取始态信息。加入可追溯体系，需缴纳基本年费及额外的注册文件费用。认证过程
对于BAP认证，申请者必须完成以下步骤。初始BAP认证有效期为1年。在随后几年，申请单位每年都有60天时限进行认证更新。
BAP的认证步骤
1. 填写并提交信息完整的认证申请表(含付款信息)。（见认证表格及适用于您的认证准则页面）除了提供申请单位资料及联系方式，申请者还必须回答若干问题，其中包括能够反映实地检验情况的自我审核。
属同一申请单位的，利用和排放同一处水资源的邻近养殖场，须单独申请并缴纳申请费。
通过的申请者会收到上书写金额为500美元的申请费发票和付款指示。对于占地面积少于50公顷的和/或年产量少于100公吨的小型养殖场，此费用可适当调整。对于仔虾数量少于1,000万的虾孵化场，费用也可作调整。
缴费后，BAP认证管理小组（水产认证委员会）办公室将审查申请表各项信息，并提供总体指导，以修正申请过程中的一些小问题或建议申请者聘请顾问。
2. 签订认证协议，并支付实地检验费用。申请者的申请通过后，会收到含有BAP认证条款及条件的认证协议。申请人签订好合同并返还给BAP认证管理小组，同时提交年度检验费用支付信息：虾养殖场和孵化场为3,000美元，加工工厂为500美元。再包装工厂为3,000美元。
3. BAP认证管理小组指定一名检验员。在考虑可能的利益冲突后，BAP挑选一个适合的ISO认证机构，并安排检验日期。
4 进行实地检验。孵化场的BAP检验通常需要一天。养殖场一般需要一至两天，在记录、许可证和其他相关文件有效的前提下，加工工厂的检验需要两至三天。
申请单位必须符合所有关键检验标准且有评分成绩的标准项成绩至少需达到70％，才能最终获取认证。五年后，已获得认证的单位则必须符合所有关键检验标准且有评分成绩的标准项成绩至少需达到80％。
评估结果会在实地检验后的10个工作日内由检验员报告给申请单位和BAP认证管理小组。申请单位自申请之日起有一年的认证时限。在某些情况下，如若申请单位此时期正在等待更新许可，而无法在时限内完成认证，则可依据BAP准则有限延长时限。
5.认证费用支付。成功通过检验和审查的申请单位，需根据全年水产品生产总量来支付认证费用(以前一个日历年为一整年)。年产量500公吨及以下的虾养殖场需支付最低500美元的认证费用。规模更大的养殖场则在原有基础上，每超过1公吨额外增加1美元/公吨认证费，上限为4,000元。例如，一个年产量为700公吨的养殖场需支付的认证费用为500美元另加200美元（超出部分），总额为700美元。
属同一申请单位的利用和排放同一处水资源的邻近养殖场，须单独申请并缴纳申请费，费用金额依照邻近养殖场的年产量总和计算。最高金额为4,000美元。
额外支付2美元/公吨，上限为12,000美元。
6. 检查网上公司一览表。在申请单位获得认证批准并支付了所有费用后，就会拥有专属的认证代码，认证证书并将同时被列入网上认证单位名单。认证单位名称及地址都会对外公开，除非申请单位特别要求。我们会对除名称、地址以外的私人信息保密。
7. 保存可追溯性信息记录。通过认证的养殖场须依照标准准则中的可追溯性规定保存每个工作车间的种苗、饲料、渔药、污水水质及收成记录。加工工厂需保存每个养殖、加工车间的信息及分销记录。虾孵化场则需保存每个育种及养殖车间关于仔虾虾种、来源、渔药及饲料等信息的记录。
